Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D4Q9Y2X8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2D4Q9Y2X8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2D4Q9Y2X8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2D4Q9Y2X8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2D4Q9Y2X8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms