Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM2AQ9Y2K7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
KDM2AQ9Y2K7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM2AQ9Y2K7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms