Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIK3Q9Y2K2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIK3Q9Y2K2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms