Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIKFYVEQ9Y2I7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIKFYVEQ9Y2I7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIKFYVEQ9Y2I7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms