Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNFSF13BQ9Y275 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFSF13BQ9Y275 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms