Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM50BQ9Y247 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM50BQ9Y247 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms