Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOD1Q9Y239 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOD1Q9Y239 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOD1Q9Y239 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms