Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SORCS3Q9UPU3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORCS3Q9UPU3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SORCS3Q9UPU3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms