Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMP17Q9ULZ9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP17Q9ULZ9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP17Q9ULZ9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms