Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRID1Q9ULK0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRID1Q9ULK0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms