Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN2Q9ULH4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRFN2Q9ULH4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms