Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PNMA3Q9UL41 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PNMA3Q9UL41 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms