Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SARDHQ9UL12 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SARDHQ9UL12 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms