Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HDAC9Q9UKV0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HDAC9Q9UKV0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC9Q9UKV0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms