Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRLS1Q9UJA2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms