Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHF11Q9UIL8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF11Q9UIL8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms