Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO3A1Q9UIG8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO3A1Q9UIG8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms