Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPA4Q9UI42 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPA4Q9UI42 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms