Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
OPN4Q9UHM6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OPN4Q9UHM6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms