Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
IFT172Q9UG01 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
IFT172Q9UG01 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
IFT172Q9UG01 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
IFT172Q9UG01 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
IFT172Q9UG01 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
IFT172Q9UG01 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
IFT172Q9UG01 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
IFT172Q9UG01 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
IFT172Q9UG01 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC32■■■□□ 2.71
IFT172Q9UG01 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
IFT172Q9UG01 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
IFT172Q9UG01 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
IFT172Q9UG01 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
IFT172Q9UG01 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms