Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CFDP1Q9UEE9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CFDP1Q9UEE9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CFDP1Q9UEE9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms