Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM10Q9UDY6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM10Q9UDY6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM10Q9UDY6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms