Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY0

SLC9A2, Sodium/hydrogen exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A2Q9UBY0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A2Q9UBY0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A2Q9UBY0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC9A2Q9UBY0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC9A2Q9UBY0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC9A2Q9UBY0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms