Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NXF1Q9UBU9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NXF1Q9UBU9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms