Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLKQ9UBT6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms