Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
REREQ9P2R6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
REREQ9P2R6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
REREQ9P2R6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
REREQ9P2R6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms