Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLHL42Q9P2K6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL42Q9P2K6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL42Q9P2K6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms