Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
RRBP1Q9P2E9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RRBP1Q9P2E9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms