Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDH10Q9P2E7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDH10Q9P2E7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms