Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP4Q9P0V3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP4Q9P0V3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4Q9P0V3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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