Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EHD3Q9NZN3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EHD3Q9NZN3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms