Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
GDE1Q9NZC3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDE1Q9NZC3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms