Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UTP6Q9NYH9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UTP6Q9NYH9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms