Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNK4Q9NYG8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms