Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKS1Q9NXB0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKS1Q9NXB0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MKS1Q9NXB0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms