Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MED29Q9NX70 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MED29Q9NX70 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MED29Q9NX70 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms