Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWK9

ZNHIT6, Box C/D snoRNA protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT6Q9NWK9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT6Q9NWK9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNHIT6Q9NWK9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms