Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ASF1BQ9NVP2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms