Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX18Q9NVP1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX18Q9NVP1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms