Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCP11L1Q9NUJ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TCP11L1Q9NUJ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCP11L1Q9NUJ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms