Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZNF275Q9NSD4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF275Q9NSD4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms