Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SALL1Q9NSC2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SALL1Q9NSC2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SALL1Q9NSC2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms