Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPORSQ9NS56 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPORSQ9NS56 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TOPORSQ9NS56 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms