Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS4Q9NRS4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS4Q9NRS4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS4Q9NRS4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms