Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYTL1Q9NRR1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTL1Q9NRR1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTL1Q9NRR1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTL1Q9NRR1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTL1Q9NRR1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTL1Q9NRR1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTL1Q9NRR1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTL1Q9NRR1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYTL1Q9NRR1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTL1Q9NRR1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTL1Q9NRR1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTL1Q9NRR1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYTL1Q9NRR1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms