Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PFDN4Q9NQP4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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