Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NRIP3Q9NQ35 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRIP3Q9NQ35 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms