Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SSU72Q9NP77 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSU72Q9NP77 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms