Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB6Q9NP58 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB6Q9NP58 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms