Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE7BQ9NP56 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7BQ9NP56 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE7BQ9NP56 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE7BQ9NP56 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE7BQ9NP56 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE7BQ9NP56 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE7BQ9NP56 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE7BQ9NP56 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE7BQ9NP56 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE7BQ9NP56 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE7BQ9NP56 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE7BQ9NP56 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms